Η ποσοτική PCR φθορισμού χρησιμοποιείται για την ανίχνευση παθογόνων και τη γενετική ανάλυση μέσω της παρακολούθησης του σήματος φθορισμού σε πραγματικό χρόνο και της ποσοτικοποίησης του DNA ή του RNA.