Τα κυψέλες κάθετης ηλεκτροφόρησης τοποθετούν το πήκτωμα κάθετα μεταξύ δύο γυάλινων πλακών και διαχωρίζουν τα δείγματα με μετακίνηση τάσης στην κάθετη κατεύθυνση.